In Deutschland umfasst EuroVelo 6 Abschnitte des Rheinradwegs, des Hohenzollern- und des Donau-Radweges bis nach Passau. Die EuroVelo 6 ist ebenfalls Teil des nationalen Radfernwegenetzes in Deutschland als D-Route 5 und 6. Alle Informationen zu den einzelnen Streckenabschnitten finden Sie auf den unten verlinkten Webseiten.
Die ersten größeren Städte, auf die der Fluss trifft, sind Ulm mit dem höchsten Kirchturm der Welt und Donauwörth mit einer der schönsten Straßen Süddeutschlands. Diese führt auch durch die spektakuläre Landschaft des Donaudurchbruchs bei Weltenburg. Regensburg, das zum UNESCO-Weltkulturerbe zählt, ist die nächste Anlaufstelle des Flusses. Fast 1.000 Gebäude in der Altstadt der Stadt erinnern an deren römisches Erbe, an Kaufleute und Heilige. Der deutsche Teil von EuroVelo 6 endet in Passau.
In Deutschland werden Fahrräder in der Regel in Regional- und Fernzügen akzeptiert, aber die Anzahl der Fahrradplätze ist begrenzt, insbesondere in IC-Zügen. Dies sollte man während der Radtourismus-Hochsaison entlang der Donau berücksichtigen. Es gibt Radfahrende, die ihre Zug-Fahrkarten ein Jahr im Voraus kaufen. Die Donautalbahn in Baden-Württemberg und Bayern bietet viel Platz für die Fahrradbeförderung und ist ein hervorragendes öffentliches Verkehrsmittel für Radfahrende.
Eine Liste der Bahnhöfe, Busbahnhöfe und Mobilitätsinformationszentren in Deutschland entlang von EuroVelo 6 - Atlantik-Schwarzes Meer finden Sie auf der Karte und im Abschnitt "Öffentlicher Verkehr" unterhalb der Karte!